Otamme näytteitä suomalaisten sika- ja broileriteurastamojen jätevesistä sekä teuraslinjassa olevista eläimistä. Näytteet viljellään metisilliiniresistentin Staphylococcus aureus -bakteerin (MRSA) sekä laajakirjoisia beetalaktamaaseja tuottavien Escherichia coli -bakteerien (ESBL/AmpC) havaitsemiseksi. Käytämme sekä fenotyyppisiä että genotyyppisiä menetelmiä bakteerien ominaisuuksien selvittämiseen. Jätevesistä ja teuraseläimistä eristettyjä bakteereja verrataan toisiinsa genomisen epidemiologian avulla.
Tutkimuksen tavoitteena on selvittää, missä määrin teurastamojen jätevesistä eristetyt MRSA- ja ESBL/AmpC -bakteerit vastaavat eläimissä esiintyviä bakteereja. Tutkimus toimii myös pilottina tuotantoeläinten jätevesiseurannan kehittämiselle.
Väitöskirjatutkijan tehtäväni on Helsingin yliopiston tutkijakoulun rahoittama.