Sijoitus-, varainhankinta- ja rahoitustoiminnan kirjanpidollinen voitto oli 57 miljoonaa euroa, joka nosti kokonaistuloksen 55 miljoonaan euroon. Suurimmat erät muodostuivat sijoitustoiminnan myyntivoitoista sekä osinkotuotoista. Sijoitustoiminnan tulokseen sisältyi 11 miljoonaa euroa sijoitusten arvonmuutoksia. Sijoitukset kirjataan tilinpäätökseen opetus- ja kulttuuriministeriön taloushallinnon koodiston mukaisesti markkina-arvoin.
Yliopiston henkilöstömäärä vuoden 2025 lopussa oli hieman alle 9 100. Henkilöstökustannukset olivat 517 miljoonaa euroa, mikä vastasi 62 prosenttia operatiivisista kokonaiskuluista. Toinen merkittävä kuluerä muodostuu opiskelu-, tutkimus- ja muista toiminnan edellyttämistä tiloista.
Vuonna 2025 Helsingin yliopiston tulot (perusrahoitus + täydentävä rahoitus) oli yhteensä 846 miljoonaa euroa sisältäen investointiavustukset 8,8 miljoonaa euroa.
Helsingin yliopiston operatiivisen toiminnan kulut olivat 848 miljoonaa euroa. Suurimmat kuluerät olivat 517 miljoonan euron henkilöstökulut ja 105 miljoonan euron tilavuokrat.
Yliopiston tärkein täydentävän tutkimusrahoituksen lähde oli Suomen Akatemia. Suomen Akatemialta saatu rahoitus oli yhteensä 126 miljoonaa euroa. Säätiöiltä saatu rahoitus oli 44 miljoonaa euroa ja EU:sta saatu rahoitus oli 44 miljoonaa euroa, joka nousi 20 prosenttia edelliseen vuoteen verrattuna.