Helsingin yliopistossa on neljä tutkijakoulua, jotka muodostuvat tohtoriohjelmista. Tutkijakoulujen alat eivät noudata tiedekunta- tai kampusrakennetta, vaan perustuvat yhteistyöhön tutkimuksessa ja tohtorikoulutuksessa. Yliopiston tutkijakoulut ja tohtoriohjelmat

Eläinlääketieteellisen tiedekunnan tohtorikoulutettavat voivat kuulua johonkin seuraavasta kuudesta tohtoriohjelmasta:

Ympäristö-, elintarvike- ja biotieteellinen tutkijakoulu, YEB

Terveyden tutkimuksen tutkijakoulu, TT

Näistä Kliinisen eläinlääketieteen tohtoriohjelmaa ja Ruokaketjun ja terveyden tohtoriohjelmaa koordinoidaan eläinlääketieteellisessä tiedekunnassa.