Johtokunta ohjaa instituutin strategista kehittämistä ja pitää yllä yhteyttä tiedekuntien päätöksentekoon.
Infrastruktuuritoimikunta suunnittelee ja kehittää keskustakampuksen tutkimusinfrastruktuurien yhteiskäyttöä. Toimikunnan puheenjohtajana toimii Matti Nelimarkka ja sihteerinä Mari Siiroinen.
Tutkimustoimikunta tukee monitieteisten tutkimusryhmien ja verkostojen yhteistyötä keskustakampuksella. Toimikunnan puheenjohtajana toimii Mikko Tolonen ja sihteerinä Pekka Mäkelä.