Talousveden laatua tarkkaillaan tutkimalla vedestä indikaattoribakteerien, esimerkiksi ulosteperäisen E. coli -bakteerin, lukumääriä. Perinteisillä bakteerien kasvuun perustuvilla viljelymenetelmillä E. coli -lukumäärätulos saadaan parissa päivässä. Gómez ym. (2025) tutkimuksessa E. coli voitiin havaita talousvedestä luotettavasti kuudessa tunnissa EU-maiden laboratorioissa käyttäen E. coli -bakteerille ominaisen RNA:n havaitsevaa menetelmää. Nopea menetelmä mahdollistaa saastumistilanteisiin puuttumisen entistä nopeammin ja voi auttaa vesivälitteisten taudinpurkausten ehkäisyssä.
E. coli on yleinen tasalämpöisten eläinten suolistossa esiintyvä bakteeri, joka ei säily elossa suoliston ulkopuolella pitkiä aikoja. Näin ollen sitä käytetään indikoimaan eli osoittamaan tuoretta ulosteperäistä saastumista. Nopea ulostesaastumisen osoittaminen talousvesiverkostoista on tärkeää, jotta voidaan torjua vesivälitteisten taudinaiheuttajien, kuten noroviruksen, kampylobakteerin tai salmonellan aiheuttamia infektioita. RNA-markkeri soveltuu hyvin elävien solujen havaitsemiseen vedestä, sillä RNA hajoaa nopeasti solun kuollessa. Elävä ja aktiivinen solu myös tarvitsee RNA:ta kaikkeen toimintaansa ja tuottaa sitä aktiivisesti, mikä helpottaa RNA-markkerin havaitsemista.
RNA-markkerianalyysi validoitiin kahdessa laboratorioiden välisessä tutkimuksessa, joihin osallistui yhteensä 19 laboratoriota eri EU-maista. Analyysin suorittaminen laboratorioissa onnistui silloinkin, kun laboratoriolla ei ollut aiempaa kokemusta RNA-markkerianalyysistä. Tulokset olivat kuitenkin parempia tutkimuksen toisella kierroksella, mikä osoittaa harjoittelun tärkeyden uusia menetelmiä kokeiltaessa. Lopulta RNA-markkerianalyysin herkkyydeksi saatiin 91 %, mikä on hieman matalampi, kuin perinteisen menetelmän 97 %:n herkkyys.
Vaikka pikamittausmenetelmä osoittautui hieman vähemmän herkäksi kuin perinteinen menetelmä, sen nopeus on silti etu talousveden laaduntarkkailussa. Nopea menetelmä mahdollistaa nopean puuttumisen saastumistilanteissa ja auttaa välttämään vesivälitteisiä taudinpurkauksia. Menetelmän herkkyys voi myös parantua harjoituksen ja käytännön kokemuksen lisääntyessä.
Viite:
Gómez, L., Brandão, J., Navarro, A., Martines, A., Sanseverino, I., Porcel-Rodríguez, E., Marinov, D., Ableitner, O., Allerberger, F., Atsma, A., Briancesco, R., Cenov, A., Cíchová, M., Coccia, A. M., Della Libera, S., De Maeyer, K., Jan de Vries, H., Elsinga, G., Heijnen, L., . . . Lettieri, T. (2025). Application of a real-time reverse transcription polymerase chain reaction for rapid detection of Escherichia coli in drinking water: an EU representative study. Environmental Research, 279, 121786. https://doi.org/10.1016/j.envres.2025.121786