Käytämme suomalaisten sikarotujen tutkimuksissa sian 60K SNP-genotyypityssirulla tuotettuja aineistoja, joilla tutkitaan sianlihan laatua, letaaleja haplotyyppejä ja tehollista populaatiokokoa. Tällä hetkellä keskitymme tarkemmin karakterisoimaan geenitoiminnan tutkimuksen ja kohdistetun DNA:n sekvensoinnin avulla aiemmin löytämiämme sianlihan laatuun vaikuttavia kandidaattigeenejä. Tätä tutkimusta tehdään yhteistyössä Bolognan yliopiston tutkimusryhmän kanssa. Ayrshire-rotuisella lypsykarjalla olemme käyttäneet yli 10 000 lehmän imputoituja 50K SNP-genotyyppejä sukusiitoksen arviointiin.
Kudinov, A. A., Mäntysaari, E. A., Pitkänen, T. J., Saksa, E. I., Aamand, G. P., Uimari, P., & Strandén, I. 2022. Single-step genomic evaluation of Russian dairy cattle using internal and external information. Journal of Animal Breeding and Genetics 139: 259-270. https://doi.org/10.1111/jbg.12660
Martikainen, K., Koivula, M. & Uimari, P. 2020. Identification of runs of homozygosity affecting female fertility and milk production traits in Finnish Ayrshire cattle. Scientific Reports 10, 3804. https://doi.org/10.1038/s41598-020-60830-9
Kudinov, A.A., Mäntysaari, E.A., Aamand, G.P., Uimari, P. & Strandén, I. 2020. Metafounder approach for single-step genomic evaluations of Red Dairy cattle. Journal of Dairy Science 103: 6299-6310. https://doi.org/10.3168/jds.2019-17483
Noskova, A., Wurmser, C., Crysnanto, D., Sironen, A., Uimari, P., Fries, R., Andersson, M., & Pausch, H. 2020. Deletion of porcine BOLL is associated with defective acrosomes and subfertility in Yorkshire boars. Animal Genetics 51: 945-949. https://doi.org/10.1111/age.12998
Martikainen, K., Sironen, A. & Uimari, P. 2018. Estimation of intrachromosomal inbreeding depression on female fertility using runs of homozygosity in Finnish Ayrshire cattle. Journal of Dairy Science 101: 11097-11107. https://doi.org/10.3168/jds.2018-14805
Smaragdov, M.G., Kudinov, A.A. & Uimari, P. 2018. Assessing the genetic differentiation of Holstein cattle herds in the Leningrad region using Fst statistics. Agricultural and Food Science 27: 96-101. https://journal.fi/afs/article/view/69777
Martikainen K., Tyrisevä A-M., Matilainen K., Pösö J. & Uimari P. 2017. Estimation of inbreeding depression on female fertility in the Finnish Ayrshire population. Journal of Animal Breeding and Genetics 134: 383-392. http://dx.doi.org/10.1111/jbg.12285
Verardo L., Sevon-Aimonen M-L., Serenius T., Hietakangas V. and Uimari, P. 2017. Whole-genome association analysis of pork meat pH revealed three significant regions and several potential genes in Finnish Yorkshire pigs. BMC Genetics 18. http://dx.doi.org/10.1186/s12863-017-0482-x
Häggman J. and Uimari P. 2016. Novel harmful recessive haplotypes for reproductive traits in pigs. Journal of Animal Breeding and Genetics 134: 129-135. http://dx.doi.org/10.1111/jbg.12240