Aleksanteri-instituutti tarjoaa useita valinnaisia opintojaksoja kaikille Helsingin yliopiston opiskelijoille kansainvälisen Venäjän, Euraasian ja itäisen Euroopan tutkimuksen maisteriohjelman järjestämänä. Itäisen Keski-Euroopan, Kaakkois-Euroopan ja Baltian tutkimuksen (IKEB) ja Ukraina-tutkimuksen opintokokonaisuuksien lisäksi tarjolla on kolme Venäjää, Euraasiaa ja itäistä Eurooppaa käsittelevää kokonaisuutta.
Lisäksi Aleksanteri-instituutti koordinoi 25 opintopisteen VIExpert-asiantuntijaopintojen valtakunnallista kokonaisuutta, jossa voit erikoistua alueasiantuntijaksi osana omaa maisteriohjelmaasi omassa yliopistossasi. Ohjelmaan kuuluu 12 yliopistoa ympäri Suomen. Yli 20-vuotisen olemassaolonsa aikana ohjelmasta on valmistunut satoja opiskelijoita, jotka ovat luoneet uraa mm. akateemisessa maailmassa, politiikassa, julkisella sektorilla ja liike-elämässä.