Toimintaamme ohjaavat sekä Helsingin yliopiston strategia että valtakunnallinen johtokunta. Yhteiskunnalliseen vaikuttavuuteen ja instituutin kehittämiseen osallistuu myös humanistisen tiedekunnan dekaanin kutsuma neuvottelukunta. Henkilöstön osuus kehittämistyössä ja päätöksenteossa on vahva. Päätöksenteosta vastaa instituutin johtaja yhdessä tiedekunnan dekaanin kanssa. Opetusohjelmien ja hankkeiden toimintaa ohjaavat lisäksi niiden omat johtokunnat ja ohjausryhmät.
Aleksanteri-instituutti toimii vuodesta 2018 lähtien hallinnollisesti Helsingin yliopiston humanistisen tiedekunnan osastona. Noudatamme Helsingin yliopiston periaatteita ja menettelyjä mm. rekrytoinnissa ja työsuhteissa, jaamme yliopiston strategian ja tuemme tiedekunnan yhteisiä tavoitteita. Aleksanteri-instituutin johtajana toimii Anna-Liisa Heusala.
Valtakunnallisen ohjausryhmän tehtävänä on
Ohjausryhmän toimikausi on neljä vuotta.
Instituutin johtaja kutsuu ohjausryhmän jäsenet instituutin johtoryhmän esityksestä. Ohjausryhmään kuuluu enintään 20 jäsentä. Jäsenet pyritään nimeämään siten, että 5–6 ohjausryhmän jäsenistä on Helsingin yliopiston tiedekunnista, mukaan lukien instituutin henkilöstön keskuudestaan valitsema edustaja. Muut jäsenet tulevat Helsingin yliopiston yhteistyötahoilta, mukaan lukien muista suomalaisista yliopistoista.
Neuvottelukunta tukee instituutin yhteiskunnallista vuorovaikutusta. Sen tehtävänä on arvioida ja kehittää instituutin toimintaa sekä välittää tietoa toimintaympäristön muutoksista.
Neuvottelukunnan jäsenet kutsuu johtokunnan esityksestä humanistisen tiedekunnan dekaani, joka myös nimeää puheenjohtajan jäsenten keskuudesta. Neuvottelukunnan toimikausi on neljä vuotta ja se kokoontuu vähintään kerran vuodessa.
Neuvottelukunnan varapuheenjohtaja
Aleksanteri-instituutin vuosibudjetti on noin 4 M€. Siitä noin kolmannes perustuu Opetus- ja kulttuuriministeriön myöntämään, valtakunnallisen tehtävän hoitamiseen tarkoitettuun rahoitukseen. Reilu kolmannes (38% vuonna 2016) tuloista on kilpailtua tutkimusrahoitusta, ja kilpaillun rahoituksen osuus on viime vuosina ollut vahvassa kasvussa. Suurimpia rahoittajia ovat Suomen Akatemia (n. 75% kilpaillusta rahoituksesta) sekä kotimaiset säätiöt ja ministeriöt. EU-rahoituksen ja muun ulkomaisen rahoituksen määrä vaihtelee vuosittain.