Helsingin observatorio on tehnyt esimerkiksi tapahtumien ja näyttelyiden tiimoilta yhteistyötä useiden tahojen kanssa. Lisäksi Observatorio on mukana myös Museoliiton Museokortissa.
Helsingin observatorion yhteistyötahoja:
- Tähtitieteellinen yhdistys Ursa
- Yliopiston almanakkatoimisto
- LUOMUS
- LumA-tiedekasvatuskeskus
- Helsingin yliopiston Fysiikan laitos
- Helsingin yliopiston Geotieteiden ja maantieteen laitos
- Helsingin yliopiston Viestintä- ja yhteiskuntasuhteet
- Helsingin yliopiston Museologian oppiaine
- Ilmatieteen laitos
- Maanmittauslaitoksen Paikkatietokeskus
- Helsingin kaupunki
- Tähtitieteen opiskelijoiden ainejärjestö Meridiaani ry
- Matikkamaa
- Euroopan avaruusjärjestö ESA
- Tiedekeskus Tuorla ja Suomen ESO-keskus
- Tekes
- Säteilyturvallisuuden edistämiskeskus STEK
- Tiedetuubi
- Palikkatakomo
- Lelumuseo Hevosenkenkä
- Haaga-Helia
- Stadin Tarhaajat ja Hunajafrendit ry
- Helsinki Design Week
- Aalto-yliopisto
- Aalto-yliopiston Medialaboratorion Crucible Studio
- Runokuu & Media Facades -festivaalit Helsingin juhlaviikoilla
- Oxford Instruments Technologies Oy