Aleksanteri-instituutti tarjoaa useita valinnaisia opintojaksoja kaikille Helsingin yliopiston opiskelijoille kansainvälisen Venäjän, Euraasian ja itäisen Euroopan tutkimuksen maisteriohjelman järjestämänä. Itäisen Keski-Euroopan, Kaakkois-Euroopan ja Baltian tutkimuksen (IKEB) ja Ukraina-tutkimuksen opintokokonaisuuksien lisäksi tarjolla on kolme Venäjää, Euraasiaa ja itäistä Eurooppaa käsittelevää kokonaisuutta.