After Prado, Cerdeño & Roig-Juñent, 1998, and Vucetich, Deschamps, Olivares & Dozo, 2005

<==o Hydrochoeridae Gray, 1825 sensu Prado, Cerdeño & Roig-Juñent, 1998 [taxonomic history] (kabybaras; kabybarat)
   |?- †Porcellusignum Casamiquela, in Angulo, 1982; U.Mioc. SA.
   |--o †Anchimys Ameghino, 1886 [incl. †Cardiodon Ameghino, 1885 (non †Cardiodon Owen, 1841, a sauropod dinosaur (Archosauria: Dinosauria: Sauropoda incertae sedis)); †Eucardiodon Ameghino, 1891] U.Mioc SA. [paraphyletic †Cardiatheriinae Kraglievich, 1930]
   |  |-- †A. pisanoi
   |  |-- †A. marshi
   |  `-- †A. leidyi
   |-- †Phugatherium Ameghino, 1887 [†Phregatherium Lydekker, 1888 (lapsus calami); †Neoanchimys Pascual & Bondesio, 1961] L.Plioc. SA. [paraphyletic †Cardiatheriinae Kraglievich, 1930]
   |-- †Xenocardia Pascual & Bondesio, 1963; U.Mioc. SA. [paraphyletic †Cardiatheriinae Kraglievich, 1930]
   |--o †Anchimysops Kraglievich, 1927; L.Plioc.-?U.Plioc. SA. [paraphyletic †Cardiatheriinae Kraglievich, 1930]
   |  `-- †A. fluminis [A. fluminus]
   |?-o †Kivutherium Francis & Mones, 1965; U.Mioc.-L.Plioc. SA. [jr. sysnon of †Cardiatherium Ameghino, 1883 (Vecetich et al., 2005] [paraphyletic †Cardiatheriinae Kraglievich, 1930]
   |  |-- †K. orientalis
   |  `-- †K. scillatoyanei
   `--+--o †Procardiatherium Ameghino, 1885; U.Mioc. SA. [paraphyletic †Cardiatheriinae Kraglievich, 1930]
      |  `-- †P. simplicidens
      |--o †Cardiatherium Ameghino, 1883 [Cardiotherium (lapsus calami)] [incl.? †Plaxochoerus Ameghino, 1886; Kivutherium Francis & Mones, 1965] U.Mioc.-?L.Plioc. SA. [paraphyletic †Cardiatheriinae Kraglievich, 1930]
      |  |-- †C. talicei
      |  |-- †C. paranense
      |  `-- †C. patagonicum Vucetich, Deschamps, Olivares & Dozo, 2005
      `--+--o †Anatochoerinae Mones & Vucetich, in Mones, 1991
         |  |?- †Contracavia Burmeister, 1885; U.Mioc. SA.
         |  `-- †Anatochoerus Vucetich & Mones, in Mones, 1991
         `--o Hydrochoerinae Gray, 1825 sensu McKenna & Bell, 1997
            |--o †Protohydrochoerinae Kraglievich, 1930
            |  |?- †Nothydrochoerus Rusconi, 1935; U.Plioc. SA.
            |  `--o †Chapalmatherium F. Ameghino, 1908 [Protohydrochoerus Rovereto, 1914] L.-U.Plioc. SA.
            |     |-- †C. novum Ameghino, 1908
            |     `-- †C. perturbidum [Protohydrochoerus Rovereto, 1914;  †Anchimysops villalobosi (juveline); Phugatherium cataclisticum (juveline)]
            `--o Hydrochoerinae Gray, 1825 [taxonomic history]
               |-- †Hydrochoeropsis Kraglievich, 1930; U.Plioc. SA.
               `--+--o †Neochoerus Hay, 1926 [†Oromys Leidy, 1853 (nomen nudum?)] [incl.? †Palaeohydrochoerus Spillmann, 1942 (nomen nudum?)] [incl. †Pliohydrochoerus Kraglievich, 1930; †Prohydrochoerus Spillmann, 1941]
                  |  `-- †N. pinckneyi
                  `--o Hydrochaeris Brunnich, 1772 [taxonomic history]
                     |-- †H. holmesi
                     |-- †H. gaylordi MacPhee, Singer & Diamond, 2000
                     |-- H. hydrochaeris (Linnaeus, 1758) (kabybara, vesisika)
                     `?- H. isthimus Goldman, 1912 (panamankabybara)

Reference(s):