HY-konserni
Varsinaisen yliopiston lisäksi Helsingin yliopiston konserniin kuuluvat Helsingin yliopistokiinteistöt Oy ja Helsingin yliopiston rahastot. Yliopistokonsernin palveluksessa on yhteensä noin 10 000 työntekijää ja sen budjetti on lähes miljardi euroa.
Helsingin yliopistokiinteistöt -yhtiöön kuuluvat aikaisemmin valtion Senaattikiinteistöjen omistamat pääkaupunkiseudun yliopistojen kiinteistöt Aalto-yliopistoa lukuun ottamatta. Helsingin yliopisto omistaa yhtiöstä noin 60 prosenttia. Muut osakkaat ovat Kuvataideakatemia, Sibelius-Akatemia, Svenska handelshögskolan ja Teatterikorkeakoulu sekä valtio.
Helsingin yliopiston rahastot on julkisoikeudellisena laitoksena toimivan yliopiston taloudesta erillään hoidettava kokonaisuus, jonka tehtävänä on tukea yliopiston toimintaa. Yliopiston rahastojen liiketoimintaa harjoittavia konserniyhtiöitä ovat Oy HaartBio Ab, Helsingin yliopiston kehityspalvelut Oy, Unigrafia Oy ja Licentia Oy. Liiketoimintaa harjoittaa myös Yliopiston Apteekki, joka ei ole yhtiömuotoinen. Yliopistokonserniin kuuluu myös lukuisia kiinteistöyhtiöitä.
Helsingin yliopiston rahastot on mukana useissa liiketoimintaa harjoittavissa, yliopistotutkimuksesta lähtöisin olevissa osakkuusyrityksissä. Lisäksi rahastoihin kuuluu noin 200 lahjoitusrahastoa, jotka tukevat tutkimusta, opetusta ja opiskelijoita mm. jakamalla apurahoja.
Yliopiston konsernijohtoon kuuluvat yliopiston hallitus ja rehtori sekä muita erikseen määrättyjä konsernijohdolle kuuluvia tehtäviä hoitavia henkilöitä. Konsernijohto vastaa yliopistokonsernin ohjauksesta ja konsernivalvonnan järjestämisestä.
