52826 Mikrobiekologia (3-5 op)
Aika: ma klo 10-12, ke klo 8-12 ja to 9-12 (5.9.-21.10.2011)
Paikka: Infokeskus Sali 4
Vastuuhenkilö: prof. Kielo Haahtela. Järjestetään yhteistyössä maatalous-metsätieteellisen tdk:n soveltavan kemian ja mikrobiologian laitoksen kanssa.
Edeltävät opinnot : Biotieteiden perusteet I (529001) ja Biotieteiden perusteet II (529002) tai vastaavat opinnot. Suositellaan suoritettavaksi 3. opiskeluvuotena.
Sisältö: Mikrobiekosysteemit maassa ja vedessä, alkuaineiden biogeokemialliset kierrot, ympäristöä kuormittavien kemikaalien biohajoavuus ja myrkyllisyys. Lisäksi mikrobien sekä eläinten, kasvien ja ihmisen väliset hyödylliset ja haitalliset vuorovaikutussuhteet
Kirjallisuus: Kurssilla esitetty kirjallisuus. Luentojen yhteydessä suositellaan luettavaksi Brock: Biology of Microorganisms (12.p.) luvut 17,18, (20,21),23,24.
Suoritustavat: Luennot, ryhmätyöt, keskustelut, esitykset ja kotitehtävät. Kurssin voi suorittaa ilman seminaariosuutta, jolloin laajuus on 3 op.
Arviointi: kurssityöskentely, kirjallinen ja suullinen kuulustelu, (0-5)
Tentti ja sen uusinnat: Ilmoitetaan luennon yhteydessä.
Ilmoittautuminen: MMTDK:n WebOodin kautta (kurssi MIKRO241, 864068 Ympäristömikrobiologia)
Lisätiedot: Pakollinen opintojakso mikrobiekologian erikoistumislinjalla

528003 Bacterial pathogenesis – a journal club and a seminar (2-4 op)

529001 Biotieteiden perusteet I (6 op) - laitoksen yhteistä opetusta, päivitetty 9.8.

528006 Johdanto viruksiin (3-4 op) also in English päivitetty 11.10.
Aika: ma ja ke klo 10-12 (2.11.-14.12.2011) >> Katso ohjelma
Paikka: Infokeskus Sali 2 (auditorio)
Vastuuhenkilö: prof. Dennis Bamford / yleinen mikrobiologia
Kirjallisuus: luentomateriaali
Arviointi: Tentti, 3 op (0-5). Seminaari, 1 op (hyväksytty/hylätty).
Tentti ja sen uusinnat: Ilmoitetaan luennon yhteydessä.
Edeltävät opinnot: Biotieteiden perusteet I (529001) ja Biotieteiden perusteet II (529002) tai vastaavat tiedot
Ilmoittautuminen: Rekisteröityminen WebOodi 6.6.-15.11.2011

Harjoitustyökurssit:

52729 Geenitekniikan työt (5 op)
Aika:
Ryhmä 1: 5.9.-16.9.2011
Ryhmä 2: 19.9.-30.9.2011 (YMBO opettaa)
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 1030
Vastuuhenkilö: suunnittelija Heikki Tuurala / yhteinen opetus
Kirjallisuus: kurssimoniste ja kurssilla jaettava materiaali
Tentti ja sen uusinnat: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Arviointi: 2/3 arvosanasta tentin perusteella (1-5) ja 1/3 arvosanasta työselostuksen perusteella (1-5).
Ilmoittautuminen: WebOodi 15.6.2011 mennessä

52807 Mikrobiologiset menetelmät (7 op)
Aika:
Ryhmä 1: 12.9.-7.10.2011 päivittäin klo 10-17
Ryhmä 2: 20.2.-16.3.2012 päivittäin klo 10-17
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 2015
Vastuuhenkilö: yliopistonlehtori Ritva Virkola / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot: 529001 Biotieteiden perusteet I ja 529004 Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt/Molekyylibiotieteiden harjoitustytöt II
Kirjallisuus: Kurssimoniste ja kurssilla jaettava materiaali
Arviointi: Tentti (0-5) ja työselostus (0-5)
Tentti: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Ilmoittautuminen: WebOodi ryhmä 1: 6.6.-30.8.2011 ja ryhmä 2: 1.10.11-24.1.2012
Lisätietoja: Kurssi järjestetään mikäli kurssille ilmoittautuu väh. 8 opiskelijaa. Opiskelijoille ilmoitetaan 1.9. järjestetäänkö kurssi (Ryhmä 1).
Opiskelijoille ilmoitetaan 25.1. järjestetäänkö kurssi (Ryhmä 2).
Huom!: Kurssi järjestetään viimeisen kerran tässä muodossa lukuvuonna 2011-2012.
Tämän jälkeen järjestetään 529310 Bakteriologian ja virologian harjoitustyöt, 5 op.

528010 Mikrobiologian erikoiskurssi / Kliininen bakteriologia (4 op)
Ei järjestetä lukuvuonna 2011-2012

528014 Course in microbial ecology (5-7 op) päivitetty 9.8.

528012 Virologian harjoitustyöt ja bioinformatiikka (6 op)
Aika: 10.10.-4.11.2011 päivittäin klo 9-17.
Laboratoriojakso 10.10.-28.10. ja
Bioinformatiikan jakso 31.10.-4.11.
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 2015
Vastuuhenkilö: yliopistonlehtorit Minna Poranen ja Janne Ravantti / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot: 529001 Biotieteiden perusteet I, 528006 Johdanto viruksiin, 529004 Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt/Molekyylibiotieteiden harjoitustytöt II
ja 52729 Geenitekniikan työt tai vastaavat tiedot. Suositellaan Geneettinen bioinformatiikka (52739) -kurssin suorittamista.
Kirjallisuus: Kurssimoniste ja kurssilla jaettava materiaali
Arviointi: Työselostus (0-5) ja tentti (0-5).
Ilmoittautuminen: WebOodi 6.6.-15.9.2011
Huom!: Kurssi järjestetään viimeisen kerran tässä muodossa lukuvuonna 2011-2012.
Tämän jälkeen järjestetään 528020 Virologian harjoitustyöt, 5 op, jonka sisältö on uudistettu.

529004 Molekyylibiotieteiden harjoitustyöt II (3 op) 14.11.-2.12.2011
Mikrobiologian jaksot: klo 13-18, Kurssisali 2015 ja 2016
I                     14.11.-18.11.2011           30 opisk.
II                    21.11.-25.11.2011           30 opisk.
Mikrobigenetiikan jaksot: klo 13-18, Kurssisali 1030
I                     21.11.-25.11.2011           30 opisk.
II                    28.11.-2.12.2011              30 opisk.
Vastuuhenkilö: sunnittelija Heikki Tuurala
Kirjallisuus: Kurssimoniste
Arviointi: Tentti (0-5)
Tentti ja sen uusinnat: Ilmoitetaan kurssin yhteydessä
Ilmoittautuminen: WebOodi 30.9.2011 mennessä
Lisätietoja: Kurssi kestää yhtä opiskelijaa kohden kaksi viikkoa siten, että ensin tehdään yhden viikon mikrobiologian jakso ja sen jälkeen yhden viikon mikrobigenetiikan jakso.

52809 Syventävä laboratorio-opetus I, 12 op (vaihtoehtoinen)
52833 Syventävä laboratorio-opetus II, 12 op
528008 Syventävä laboratorio-opetus III, 12 op
Aika: Sovitaan opiskelijan kanssa
Paikka: Tutkimusryhmät
Vastuuhenkilö: Erikoistumislinjojen vastuuprofessorit
Huom! 52833 ja 528008 –opintojaksot suoritettava ennen pro gradu –työtä.

Kaksi kokopäiväistä 8 viikon harjoittelujaksoa, joissa opiskelija perehtyy mikrobiologiseen tutkimustyöhön henkilökohtaisen opettajan johdolla. Harjoittelujaksot liittyvät kahteen erilliseen tutkimusprojektiin. Opintojaksot suoritetaan opiskelijan valitsemalla mikrobiologian erikoistumislinjalla, ja ne suoritetaan ennen pro gradu -työtä. Harjoittelun alussa opiskelija tutustuu tutkimusongelmaan lukemalla hänelle annettavat artikkelit sekä keskustelulla ko. tutkimusongelmasta. Jakson aikana opiskelija perehdytetään geenitekniikan lainsäädäntöön ja sen asettamiin vaatimuksiin ko. projektissa ja hän laatii työstään kirjallisen riskinarvion. Harjoittelujakson lopussa opiskelija kirjoittaa työstään lyhyen raportin, joka jätetään ohjaajalle yhdessä laboratoriopäiväkirjan kanssa. Tarkemmat ohjeet harjoittelusta kurssin kotisivulta.