Yleisen mikrobiologia opetusohjelma 2009 - 2010

Tentit | Opintoneuvonta | Vastuuprofessori | Yhteystiedot | Pääainetoimikunta

HUOM! 52729 Geenitekniikan työt -kurssin ilmoittautuminen lukuvuoden 2009-2010 opetukseen on avattu WebOodissa. Ilmoittautuminen 25.8.2009 meneessä.

HUOM ! Ilmoittautuminen harjoitustöihin ja seminaareihin WebOodin kautta. Suositellaan myös rekisteröitymistä luennoille WebOodissa. Tentteihin ilmoittautuminen WebOodissa.

Luennot / seminaarit
52826 Mikrobiekologia (5 op)
528003 Bacterial pathogenesis - a journal club and a seminar (2-4 op)
529001 Biotieteiden perusteet I (5 op)
529002 Biotieteiden perusteet II (5 op)
528006 Johdanto viruksiin (3-4 op)
528001 Mikrobiologian proseminaari ja äidinkielen opinnot (3 op)
52831 Molekyylimikrobiologian seminaari (3 op)
52818 Mikrobifysiologia, -biotekniikka ja -genomiikka (5 op)
52878 Infektioimmunologia (2 op)
52748 Mikrobien genetiikka ja genomiikka (4 op) - kts perinnöllisyystiede
52773 Immunobiology (3 op) >> kts. perinnöllisyystiede
Viikin kampuksen yhteiset virologian opinnot

Harjoitustyökurssit
52729 Geenitekniikan työt (5 op) Ilmoit. 25.8.2009 mennessä
52807 Mikrobiologiset menetelmät (7 op), syksy Ilmoit. 31.8.2009 mennessä
528010 Yleisen mikrobiologian erikoiskurssi -Kliininen bakteriologia Ilmoit. 1.9.2009 mennessä
528014 Course in microbial ecology/Mikrobiekologian erikoiskurssi (4-6 op )
528012 Virologian harjoitustyöt ja bioinformatiikka, (6 op)
529004 Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt (3 op)
528007 Molekyylimikrobiologian harjoitustyöt, (9 op)
52808 Mikrobigenetiikan työt, (5 op)
52807 Mikrobiologiset menetelmät, (7 op), kevät
Syventävä laboratorio-opetus
Muu opetus (mikrobiologia, virologia, molekyylibiologian aineryhmä)
Loppukuulustelut

Luennot - Syksy 2009:

52826 Mikrobiekologia (5 op) - Luento
Aika: ma klo 10-12, ke klo 8-12 ja to 9-12 (7.9.-22.10.2009)
Paikka: varmista sali !
Vastuuhenkilö: prof. Kielo Haahtela / yleinen mikrobiologia. Järjestetään yhteistyössä maatalous-metsätieteellisen tdk:n soveltavan kemian ja mikrobiologian laitoksen kanssa.
Edeltävät opinnot : Biotieteiden perusteet I (529001) ja Biotieteiden perusteet II (529002)
Kirjallisuus: Luentomateriaali. Luentojen yhteydessä suositellaan luettavaksi Brock: Biology of Microorganisms jaksot II ja III. >> Kurssin kotisivu
Arviointi: Tentti (0-5)
Tentti ja sen uusinnat: Ilmoitetaan luennon yhteydessä.
Ilmoittautuminen: MMTDK:n WebOodin kautta (kurssi MIKRO241 Ympäristömikrobiologia)

528003 Bacterial pathogenesis - a journal club and a seminar (2-4 op)
Time: Thursday 1.10.-26.11.2009 at 14-16. First meeting Thursday 1.10.2009 at 14.00
Place: Biocenter 1 C, 3 rd floor, YMBO reference library
Contact person: prof. Timo Korhonen / general microbiology
Previous studies: Basic and cum laude-level studies in general microbiology. The course is also suitable for postgraduate students. The number of participants is limited to 8 students.
More information: Student advisor Ritva Virkola.
Registration and a short motivation to the seminar: WebOodi 6.6.-21.9.2009
The journal club addresses the molecular and cellular biology of bacterial pathogens as well as their pathogenomics and will use as material original landmark articles on the field. The purpose is to train students in molecular pathogenesis and critical reading of research articles.

529001 Biotieteiden perusteet I (5 op) - Luento. Kuuluu laitoksen yhteiseen opetukseen
Aika: 19.10.– 4.12.2009 päivittäin klo 8 – 10
Paikka: Viikki  ls B1
Vastuuhenkilö: Heikki Tuurala / yhteinen opetus
Tentit: Ilmoitetaan luentojen yhteydessä
Ilmoittautuminen: WebOodi

528006 Johdanto viruksiin (3-4 op) - Luento
NB! Lectures will be held in Finnish. For English speaking students the exam is based on provided reading material in English. 
Aika: ma ja ke klo 10-12 (2.11.-16.12.2009)
Paikka: Biokeskus 2, ls 2012
Vastuuhenkilö: prof. Dennis Bamford / yleinen mikrobiologia
Kirjallisuus: luentomateriaali. >> Kurssin kotisivu | >> Luentosarjan ohjelma
Arviointi: Tentti (0-5)
Tentti ja sen uusinnat: Ilmoitetaan luennon yhteydessä.
Edeltävät opinnot: Biotieteiden perusteet I (529001) ja Biotieteiden perusteet II (529002) tai vastaavat tiedot
Ilmoittautuminen: Rekisteröityminen WebOodi 6.6.-16.11.2009
Viikin kampuksen yhteiset virologian opinnot - kts. tarkemmin virologian opetus

Harjoitustyökurssit:

52729 Geenitekniikan työt (5 op)
Aika: Ryhmä 1) 31.8.-11.9.2009
Ryhmä 2) 14.9.-25.9.2009
Ryhmä 3) 8.3.-19.3.2010
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 1030
Vastuuhenkilö: sunnittelija Heikki Tuurala /  yhteinen opetus
Kirjallisuus: kurssimoniste, menetelmämoniste ja kurssilla jaettava materiaali
Tentti ja sen uusinnat: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Arviointi: Tentti (0-5), työvihko ja työselostus (hyväksytty/hylätty)
Ilmoittautuminen: Kaikkiin ryhmiin 25.8.2009  mennessä WebOodiin

52807 Mikrobiologiset menetelmät (7 op)
Aika: Ryhmä I: 14.9.-9.10.2009  Ryhmä II: 22.2.-19.3.2010  päivittäin klo 10-18   
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 2015
Vastuuhenkilö: yliopistonlehtori Ritva Virkola / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot: Biotieteiden perusteet I (529001) ja Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt (529004)
Kirjallisuus: Kurssimoniste ja kurssilla jaettava materiaali. >> Kurssin kotisivu
Arviointi: Tentti (0-5) ja työselostus (0-5)
Tentti: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Ilmoittautuminen: WebOodi Ryhmä I: 6.6.-31.8.2009 ja Ryhmä II: 1.11.09-24.1.10
Lisätietoja: Kurssi järjestetään mikäli kurssille ilmoittautuu väh. 8 opiskelijaa.
Opiskelijoille ilmoitetaan 1.9. järjestetäänkö kurssi (Ryhmä I).
Opiskelijoille ilmoitetaan 25.1. järjestetäänkö kurssi (Ryhmä II).

528010 Yleisen mikrobiologian erikoiskurssi:
Kliinisen bakteriologian erikoiskurssi (3 op)
Aika:  28.9.-9.10.2009       
Paikka: Biokeskus 1, luentosalit ja kurssisali 2016, osittain myös Meilahdessa
Vastuuhenkilö ja pääaine: Jenni Antikainen (HUSLAB), Ritva Virkola / yleinen mikrobiologia
Ennakkovaatimukset: Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt (529004), Mikrobiologiset menetelmät (52807), Geenitekniikan työt (52729).
Tavoite: tutustua kliiniseen bakteriologiaan diagnostiikan näkökulmasta, näytteenkäsittelystä analysointiin. Ymmärtää laadunvalvonnan merkitys.
Sisältö: Yleisempien infektioita aiheuttavien bakteerien tunnistus, molekulaarista diagnostiikkaa, näytteenkäsittely, laadunvalvonta, sairaalainfektioita aiheuttavien bakteerien diagnostiikka, mikrobilääkkeet, virtsaviljely, ulosteviljely, märkänäytteen viljely.
Kirjallisuus: Kurssimoniste ja kurssilla jaettava materiaali, sekä kirja Mikrobiologia ja infektiosairaudet (Huovinen, Meri, Peltola, Vaara, Vaheri, Valtonen, toim.) >> Kurssin kotisivu
Arviointi: Tentti (0-5) ja työselostus (0-5)
Tentti: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Ilmoittautuminen: Kurssille mahtuu 12 opiskelijaa. Kurssille otetaan ensisijaisesti yleisen mikrobiologian perustutkintoa suorittavia pääaineopiskelijoita, jotka eivät ole aikaisemmin tehneet kliinistä bakteeridiagnostiikkaa. Ilmoittautuminen tapahtuu WebOodin kautta ja ilmoittautumiseen tulee liittää mukaan perustelut, miksi haluaa osallistua kurssille. Ilmoittautumisaika: 6.6.- 1.9.2009. Kurssille hyväksyttyjen lista tulee kurssin www-sivulle ja ilmoitustaululle 3.9.09.

528014 Mikrobiekologian erikoiskurssi (4-6 op )
Course in microbial ecology
Suitable for English-speaking students.
Time: 19.10.- 04.11.2009  klo 10-18
Place: course room 2016, Biocenter 1
Person in charge and subject: Docent Kim Yrjälä/ general microbiology.
Prerequisities: Basics in biosciences I and II, Practical work in microbiology and microbial genetics, Practical work in gene technology, Lectures in microbial ecology or corresponding particulars.
Aim: To study ecologically important microbes in pristine and polluted environments as well as fungi in indoor dust with molecular genetic methods, and to demonstrate practical usefulness of PCR-based methods in environmental and health technology.
Contents: In the course students are acquainted with research of soil and plant ecosystems as well as indoor health by studying microbial communities starting from DNA isolation and ending up in phylogenetic analysis of bacterial, fungal and archaeal sequences. Excursions are arranged to institutions related to the topics of the course. Sampling is arranged in pre course on September 15th and excursion combined with methane measurements on September 22nd.
Literature: The course handout and reference material given during the course.
>> Homepage of the course and pdf
Grading: Exam (0-5) and work report (0-5)
Exam: to be decided during the course
Enrolment: Weboodi 6.6. - 11.9.2009, or Kim Yrjälä, kim.yrjala@helsinki.fi.
Number of participants is twelve. The course is suited for those interested in environmental microbiology or generally in genetic methods to study the environment, main and secondary subject students.

528012 Virologian harjoitustyöt ja bioinformatiikka (6 op)
Methods in Virology and Bioinformatics 2009/2010
NB! The course manual is in English and teaching is mainly in Finnish.
Aika: 12.10.-6.11.2009   päivittäin klo 9-17. Laboratoriojakso 12.10.-30.10. ja   Bioinformatiikan jakso 2.11.-6.11.2009
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 2015
Vastuuhenkilö: vs.  yliopistonlehtorit Minna Poranen ja Janne Ravantti / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot : Biotieteiden perusteet I (529001), Johdanto viruksiin (528006), Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt (529004) ja Geenitekniikan työt (52729) tai vastaavat tiedot. Suositellaan Geneettinen bioinformatiikka (52739) -kurssin suorittamista.
Kirjallisuus: Kurssimoniste ja kurssilla jaettava materiaali. >> Kurssin kotisivu
Arviointi: Tentti (0-5), työselostukset (0-5), tehtävä bioinformatiikasta (hyväksytty/hylätty), esitelmä (hyväksytty/hylätty).
Ilmoittautuminen: WebOodi 6.6.-15.9.2009

529004 Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt (3 op)
Mikrobiologian jaksot: klo 13-18, Kurssisali 2015 ja 2016
I           16.11.-20.11.09
II          23.11.-27.11.09
III         30.11.-4.12.09
IV        7.12.-11.12.09
Mikrobigenetiikan jaksot: klo 13-18, Kurssisali 1030
I           23.11.-27.11.09
II          30.11.-4.12.09
III         7.12.-11.12.09
IV        14.12.-18.12.09
Vastuuhenkilö: sunnittelija Heikki Tuurala / yhteinen opetus
Kirjallisuus: Kurssimoniste. >> Kurssin kotisivu
Arviointi: Tentti (0-5)
Tentti ja sen uusinnat: Ilmoitetaan kurssin yhteydessä ja löytyvät kurssin kotisivulta
Ilmoittautuminen: WebOodi
Lisätietoja: Kurssi kestää yhtä opiskelijaa kohden kaksi viikkoa siten, että ensin tehdään yhden viikon mikrobiologian jakso ja sen jälkeen yhden viikon mikrobigenetiikan jakso.

52809 Syventävä laboratorio-opetus I, 12 op (vaihtoehtoinen)
52833 Syventävä laboratorio-opetus II, 12 op
528008 Syventävä laboratorio-opetus III, 12 op
Aika: Sovitaan opiskelijan kanssa
Paikka: Yleisen mikrobiologian tutkimusryhmät
Vastuuhenkilö: Erikoistumislinjojen vastuuprofessorit. >> Kurssin kotisivu
Huom! 52833 ja 528008 –opintojaksot suoritettava ennen pro gradu –työtä.
Kaksi kokopäiväistä 8 viikon harjoittelujaksoa, joissa opiskelija perehtyy mikrobiologiseen tutkimustyöhön henkilökohtaisen opettajan johdolla. Harjoittelujaksot liittyvät kahteen erilliseen tutkimusprojektiin. Opintojaksot suoritetaan opiskelijan valitsemalla mikrobiologian erikoistumislinjalla, ja ne suoritetaan ennen pro gradu -työtä. Harjoittelun alussa opiskelija tutustuu tutkimusongelmaan lukemalla hänelle annettavat artikkelit sekä keskustelulla ko. tutkimusongelmasta. Jakson aikana opiskelija perehdytetään geenitekniikan lainsäädäntöön ja sen asettamiin vaatimuksiin ko. projektissa ja hän laatii työstään kirjallisen riskinarvion. Harjoittelujakson lopussa opiskelija kirjoittaa työstään lyhyen raportin, joka jätetään ohjaajalle yhdessä laboratoriopäiväkirjan kanssa.

Kevät 2010 - Luennot ja seminaarit:

529002 Biotieteiden perusteet II (5 op) - Luento. Kuuluu laitoksen yhteiseen opetukseen
Aika: 7.1. – 12.2. päivittäin klo 8 – 10
Paikka: Infokeskus ls. 1
Vastuuhenkilö: Heikki Tuurala / yhteinen opetus
Tentit: Ilmoitetaan luentojen yhteydessä
Ilmoittautuminen: WebOodi

52748 Mikrobien genetiikka ja genomiikka (4 op)
Vastuuhenkilö: Yliopistonleht. Hannu Saarilahti / perinnöllisyystiede
Lisätietoja: >> katso perinnöllisyystiede/opetus

52773 Immunobiology (3 op) >> katso perinnöllisyystiede

528001 Mikrobiologian proseminaari ja äidinkielen opinnot (3 op)
Aika: ti ja to klo 8.30-10 (26.1.-6.5.2010)
Paikka: Biokeskus 1, sh 3107
Vastuuhenkilö: prof. Kielo Haahtela / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot: Mikrobiologian perusopinnot
Kirjallisuus: Luentomateriaali, esitykseen liittyvä tieteellinen kirjallisuus.
>> Kurssin kotisivu
Arviointi: Hyväksytty / hylätty
Ilmoittautuminen: WebOodi 1.11.2009-5.1.2010

52831 Molekyylimikrobiologian seminaari (3 op)
Aika: to klo 14-16 (4.2.-6.5.2010)
Paikka: Seminaaripaikka vaihtunut. Ilmoitetaan erikseen seminaariin ilmoittautuneille opiskelijoille.
Vastuuhenkilö: prof. Timo Korhonen / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot: Pääaineopiskelijat osallistuvat seminaariin syventävien opintojen aikana
Kirjallisuus: Aiheeseen liittyvää tieteellistä kirjallisuutta.
>> Kurssin kotisivu
Arviointi: Seminaariesitys (0-5)
Ilmoittautuminen: WebOodi 1.11.2009-14.1.2010

52818 Mikrobifysiologia,-biotekniikka ja -genomiikka (5 op) - Luento
Aika: Ma, ke ja pe  klo 10-12  (15.3.-23.4.2010)        
Paikka: Infokeskus, sali 3  Sali 3 
Paikka: Muutos: Luentosalit vaihtelevat; 15.3. ja 17.3. Biokeskus 2 Aud. 1041, muut salit luento-ohjelmassa (word, pdf) kurssin kotisivulla viim. 1 viikko ennen kurssin alkua
Vastuuhenkilö: yliopistonlehtori Ritva Virkola / yleinen mikrobiologia
Kirjallisuus: Opintojakso perustuu alan asiantuntijoiden luentoihin ja luentojen yhteydessä jaettavaan materiaaliin. Mikrobiologian perusteiden kertaamiseksi suositellaan luettavaksi Brock: Biology of Microorganisms jaksot I ja VI.
>> Kurssin kotisivu
Arviointi: tentti asteikolla 0-5
Tentti ja sen uusinnat: Ilmoitetaan luennon yhteydessä.
Edeltävät opinnot: Edellyttää mikrobiologian ja biokemian perusteiden osaamista. Suositellaan suoritettavaksi 3 vuonna.
Ilmoittautuminen: Rekisteröityminen WebOodi 1.11.2009-29.3.2010

52878 Infektioimmunologia (2 op) - Luento
Aika: Ti ja to klo 10-12 (8.4., 13.4., 15.4., 20.4., 22.4., 27.4., 29.4., 4.5., 6.5., 11.5., 18.5.2010)
Paikka: Infokeskus sali 3
Vastuuhenkilö: yliopistonlehtori Ritva Virkola / yleinen mikrobiologia
Kirjallisuus: Luentomateriaali. Luentojen yhteydessä suositellaan luettavaksi Brock: Biology of Microorganisms jaksot IV ja V.
>> Kurssin kotisivu
Arviointi: Tentti (0-5)
Tentti ja sen uusinnat: ilmoitetaan luennon yhteydessä.
Edeltävät opinnot: Biotieteiden perusteet I ja II (529001 ja 529002), Immunobiology (52773)
Ilmoittautuminen: Rekisteröityminen WebOodi 1.11.2009-22.4.2010

Harjoitustyökurssit:

528007 Molekyylimikrobiologian harjoitustyöt, (9 op)
Aika: 18.1.-12.2.2010   päivittäin klo 10-18  
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 2015
Vastuuhenkilö: yliopistonlehtori Benita Westerlund-Wikström / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot: Geenitekniikan työt (52729), Mikrobiologiset menetelmät (52807), Virologian harjoitustyöt ja bioinformatiikka (528012) ja Mikrobigenetiikan työt (52808 tai 52721)
Kirjallisuus: Kurssimoniste, kurssilla jaettava oheismateriaali
>> Kurssin kotisivu
Arviointi: työselostukset (0-5)
Tentti: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Lisätietoja: Suoritettava ennen Syventäviä laboratorio-opetus II ja III -jaksoja.
Ilmoittautuminen: WebOodi 1.11.2009-18.12.2009

52807 Mikrobiologiset menetelmät, (7 op), kevät
Aika: Ryhmä II: 22.2.-19.3.2010  päivittäin klo 10-18    
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 2015
Vastuuhenkilö: yliopistonlehtori Ritva Virkola / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot: Biotieteiden perusteet I (529001) ja Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt (529004)
Kirjallisuus: Kurssimoniste ja kurssilla jaettava materiaali
>> Kurssin kotisivu
Arviointi: Tentti (0-5) ja työselostus (0-5)
Tentti: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Ilmoittautuminen: WebOodi Ryhmä II: 1.11.2009-24.1.2010
Lisätietoja: Kurssi järjestetään mikäli kurssille ilmoittautuu väh. 8 opiskelijaa. Opiskelijoille ilmoitetaan 25.1. järjestetäänkö kurssi (Ryhmä II).

52729 Geenitekniikan työt (5 op)
Aika: Ryhmä 3. 8.3.-19.3.2010
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 1030
Vastuuhenkilö: sunnittelija Heikki Tuurala / yhteinen opetus
Kirjallisuus: kurssimoniste, menetelmämoniste ja kurssilla jaettava materiaali
Tentti ja sen uusinnat: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Arviointi: Tentti (0-5), työvihko ja työselostus (hyväksytty/hylätty)
Ilmoittautuminen: Kaikkiin ryhmiin 25.8.2009  mennessä WebOodi.
Ilmoittautuminen avataan tammikuussa, jos tähän ryhmään jää syksyllä vapaita kurssipaikkoja.

52808 Mikrobigenetiikan työt, (5 op)
Aika: 12.4.-30.4.2010  päivittäin klo 12.30- n. 17 
Paikka: Biokeskus 1, Kurssisali 2015
Vastuuhenkilö:  vs. yliopistonlehtori Elina Roine / yleinen mikrobiologia
Edeltävät opinnot: Mikrobiologian ja mikrobigenetiikan harjoitustyöt (529004), Geenitekniikan työt (52729), Mikrobiologiset menetelmät (52807)
Kirjallisuus: Kurssimoniste
>> Kurssin kotisivu
Arviointi: Kuulustelu tai työselostukset (0-5)
Tentti: Sovitaan kurssin yhteydessä.
Ilmoittautuminen: WebOodi 1.11.2009-15.3.2010
Lisätietoja: Kurssin opetussisältö vastaa perinnöllisyystieteen (52721) Mikrobigenetiikan työt –kurssia

Syventävä laboratorio-opetus
52809 Syventävä laboratorio-opetus I (12 op) (vaihtoehtoinen opintojakso)
Vastuuhenkilö: prof. Kielo Haahtela

52833 Syventävä laboratorio-opetus II, 12 op
528008 Syventävä laboratorio-opetus III, 12 op
Aika: Sovitaan opiskelijan kanssa
Paikka: Yleisen mikrobiologian tutkimusryhmät
Vastuuhenkilö: Erikoistumislinjojen vastuuprofessorit
>> Kurssin kotisivu
Huom! 52833 ja 528008 –opintojaksot suoritettava ennen pro gradu –työtä.

Kaksi kokopäiväistä 8 viikon harjoittelujaksoa, joissa opiskelija perehtyy mikrobiologiseen tutkimustyöhön henkilökohtaisen opettajan johdolla. Harjoittelujaksot liittyvät kahteen erilliseen tutkimusprojektiin. Opintojaksot suoritetaan opiskelijan valitsemalla mikrobiologian erikoistumislinjalla, ja ne suoritetaan ennen pro gradu -työtä. Harjoittelun alussa opiskelija tutustuu tutkimusongelmaan lukemalla hänelle annettavat artikkelit sekä keskustelulla ko. tutkimusongelmasta. Jakson aikana opiskelija perehdytetään geenitekniikan lainsäädäntöön ja sen asettamiin vaatimuksiin ko. projektissa ja hän laatii työstään kirjallisen riskinarvion. Harjoittelujakson lopussa opiskelija kirjoittaa työstään lyhyen raportin, joka jätetään ohjaajalle yhdessä laboratoriopäiväkirjan kanssa.

Mikrobiologian erikoiskurssit (528010)
Lääketieteellisen mikrobiologian, virologian ja mikrobiekologian erikoistumislinjojen opiskelijoille suunniteltuja tiettyyn aihepiiriin liittyviä luento- ja harjoitustyökursseja. Mikrobiologian erikoiskursseilla tai muilla vastaavilla syventävillä erikoiskursseilla, jotka liittyvät erikoistumislinjan aihepiireihin, voidaan osittain tai kokonaan korvata (528008) Syventävä laboratorio-opetus III (12 op)

MUU OPETUS

Yleisen mikrobiologian opintoihin voi sisällyttää molekyylibiologian aineryhmän (biokemia, perinnöllisyystiede, yleinen mikrobiologia ja biotekniikka), virologian (Viikin kampuksen yhteiset virologian opinnot ) ja muita mikrobiologian (myös MMTDKn) opintojaksoja. Kts.tarkemmin pääaineiden opetusohjelmaa.

Viikin biotieteiden tutkijakoulu (VGSB) järjestää luento-opetusta, joka soveltuu opintojensa loppuvaiheessa oleville perustutkinto-opiskelijoille vaihtoehtoisiin opintoihin. Opetusohjelmasta tarkemmin http://www.biocenter.helsinki.fi/viikkigs/

528005 Kandidaatintutkielma ja kypsyysnäyte, 6 op
Tutkielman aihe sovitaan Mikrobiologian seminaarin yhteydessä prof. Kielo Haahtelan kanssa tai aiheen voi sopia erikoistumislinjan vastuuprofessorin kanssa. Kypsyysnäyte sisältää esseemuotoisen, hyvällä äidinkielellä kirjoitetun vastauksen tutkielman aihepiiriin läheisesti liittyvään kysymykseen. Kypsyysnäytteestä katsotaan äidinkieli ja perehtyneisyys opinnäytteen alaan. Kandidaatintutkielman yleisohjeet löytyvät tiedekunnan sivulta.

50109 Pro gradu -tutkielma ja kypsyysnäyte 40 op
FM tutkinnon opinnäyte koostuu kokeellisesta työstä (3 kk, 24 op) ja kirjallisesta osasta (16 op). Edeltävät suoritukset: yleisen mikrobiologian aineopinnot sekä syventävä laboratorio-opetus II ja III. Aiheesta ja suorituspaikasta sovitaan etukäteen prof. Timo Korhosen kanssa. Kokeellinen työ suoritetaan yleisen mikrobiologian dosentin ohjauksessa. Opiskelija laatii ohjaajan kanssa työlle kirjallisen suunnitelman, jonka hyväksymisen jälkeen työn voi tehdä. Hyväksytty pro gradu -suunnitelma jätetään yleisen mikrobiologian kansliaan. Kokeellisen osan lisäksi pro gradu -tutkielmaan sisältyy aiheeseen liittyvä kirjallisuuskatsaus. Pro gradu -tutkielma jätetään kahtena kappaleena. Pro gradu -työstä pidetään englannin kielinen seminaariesitelmä (20 min) esim. tutkimusryhmän omissa kokouksissa. Seminaariesitelmän ajankohta ilmoitetaan etukäteen opintoneuvojalle. Kypsyysnäyte sisältää esseemuotoisen, hyvällä äidinkielellä kirjoitetun vastauksen tutkielman aihepiiriin läheisesti liittyvään kysymykseen. Kypsyysnäytteestä katsotaan perehtyneisyys opinnäytteen alaan. Jos opiskelija ei ole tehnyt kypsyysnäytettä LuK-tutkinnon yhteydessä, niin tässä kypsyysnäytteessä katsotaan myös äidinkielen osaaminen. Yleisohjeet pro gradu -tutkielmasta löytyy tiedekunnan sivulta.

Työharjoittelut

52883 Työharjoittelu - aineopinnot, 1-3 op
52887 Työharjoittelu - syventävät opinnot, 2-6 op
Yleisen mikrobiologian opiskelijat voivat saada työharjoittelusta esim. kesätöistä opintopisteitä. Yhden työharjoittelusuorituksen voi saada vai kerran opintojen aikana ja op-määrä riippuu työjakson pituudesta ja työn vaativuudesta. Työharjoittelusta kirjoitetaan muutaman sivun mittainen työharjoittelukertomus, jonka perusteella opintoneuvoja arvioi harjoittelusta saatavan op-määrän. Mukaan liitetään kopio työtodistuksesta.

Loppukuulustelut
Tentitään yleisen mikrobiologian yleisinä tenttipäivinä

52817 Mikrobiologian kuulustelu, 8 op
Madigan, M.T. & Martinko, J.M.: Brock Biology of Microorganisms. Pearson Prentice Hall (11.p.2006; 992s.). Kirjan voi tenttiä kerralla tai kahdessa osassa, jolloin ensimmäiseen osaan kuuluvat kappaleet 1-11 sekä kappaleet 15-17 ja toiseen osaan kuuluvat kappaleet 12-14 ja 18-31.
TAI
Madigan, M.T., Martinko, J.M., Dunlop P.V. & Clark D.P.: Brock Biology of Microorganisms. Pearson Prentice Hall (12.p.2009; 1061). Kirjan voi tenttiä kerralla tai kahdessa osassa, jolloin ensimmäiseen osaan kuuluvat kappaleet 1-14 sekä kappaleet 19-21 ja toiseen osaan kuuluvat kappaleet 15-18 ja 22-37. (Huom! 12.p. ilmestynyt jo keväällä 2008)

Vastuuprof. Kielo Haahtela. Mikrobiologian kuulustelu suositellaan suoritettavaksi toisen opintovuoden aikana.

52834 Mikrobiologian loppukuulustelu (laudatur), 9 op
Kirjat erikoistumislinjan mukaan (kts. tutkintovaatimukset ). Loppukuulustelu voidaan suorittaa kahdessa osassa. Tentittävä kirjallisuus sovitaan professorin kanssa.

Lääketieteellinen mikrobiologia: vastuuprof. Timo Korhonen.
Virologia: vastuuprof. Dennis Bamford.
Mikrobiekologia: vastuuprof. Kielo Haahtela.

52860 Lisensiaattikuulustelu 7-15 op
Tentittävä kirjallisuus sovitaan vastuuprofessorin kanssa.