51072 Biomolekyylit /Biomolecules (5 op)
Aika: 7.9-14.10.2009, ma klo 10-12, ke klo 12-14
Paikka: BIO2 auditorio 1041
Laskuharjoitukset:
MA 14.09.2009 08:30-10:00 BIO2 AUD 1041
MA 21.09.2009 08:30-10:00 BIO2 AUD 1041
MA 28.09.2009 08:30-10:00 BIO2 AUD 1041
MA 05.10.2009 08:30-10:00 BIO2 AUD 1041
Laskettavat laskut jaetaan ensimmäisellä luentokerralla 7.9.2009.
Edeltävät opinnot: Sivuaineopiskelijoille suositellaan: 529001 Biotieteiden perusteet I, 55395 Kemian perusteet tai vastaava
Vastuuhenkilö: Prof. Kari Keinänen, Yliopistonlehtori Tuomas Haltia (laskuharjoitukset)
Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tavoite on perehdyttää opiskelija keskeisten biomolekyylien rakenteisiin ja ominaisuuksiin ja tärkeimpiin biokemiallisiin tutkimusmenetelmiin. Kurssilla käsitellään mm. vesi biologisena liuottimena, biomolekyylien ei-kovalenttiset vuorovaikutukset, aminohapot, proteiinien rakenne ja laskostuminen proteiini-ligandi-vuorovaikutus ja katalyysi, lipidit ja biologisten kalvojen rakenne ja ominaisuudet, aineiden siirto solukalvojen läpi, sokerit ja hiilihydraatit, nukleotidit ja nukleotidikofaktorit, RNA:n ja DNA:n rakenne ja fysikaalis- kemialliset ominaisuudet.
Kirjallisuus: Nelson ja Cox: Lehninger Principles of Biochemistry, 5. painos, W.H. Freeman, 2008; kappaleet 1-5, 6.1.-6.2., 7-8, 10-12
Suoritustavat: Luentoihin (24 tuntia) ja oppikirjaan perustuva tentti.
Tentit:
Arviointi: Arvostelu asteikolla 0-5 .
Luento-ohjelma: Moodle

51079 Biokemia tutuksi/ An introduction to Biochemistry (1 op osana HOPSia)
Aika: 15.9. - 10.12., ti klo 12-14
Paikka: BIO2 sh 3041
Tavoite: Katsaus tutkimustoimintaan biokemian osastolla sekä esitelmiä valaisemaan biokemistien työelämään sijoittumista
Vastuuhenkilö: FT Annakaisa Herrala.
Edeltävät suoritukset: -
Arvostelu: Hyväksytty/hylätty läsnäolon perusteella.
Lisätiedot: Sisältää osion ATK-ajokortista: TVT-ajokortin tiedonhankinta. >> Kurssisivu

510084 Channels and Transporters (3 ects)
Time: 27.10-15.12.2009, Tuesdays at 14.15-16.00
Place: seminar room 3041 (BIO2)
Contact persons: Prof. Kari Keinänen and Docent Claudio Rivera (Institute of Biotechnology)
Course description and goals: The course seeks to provide knowledge on structural, molecular and cellular biology of ion channels and transporters and their function in different biological systems. In addition, relevant key techniques are covered. The course requires basic background knowledge on biochemistry and cell biology and is intended for advanced (Master´s level) undergraduates of biosciences, but is also suitable for graduate students. The course consists of introductory lectures given by experts, problem-based discussions, and essays to be written by the students. Assignments will be given on the first lession.
Literature: Book chapters, review articles and current research literature.
Requirements for passing the course: There is no formal exam. To pass the course, active participation and an own essay are required.
Previous studies: B.Sc. or equivalent studies.
Additional information: Course language is English.
Course Website: to be announced

51212 Kliininen biokemia /Clinical Biochemistry(4 op)
Aika: Luennot 5.10.-16.10.2009 ma, ke, pe klo 13-15.30, jonka jälkeen pakolliset seminaarit erikseen sovittavina aikoina.
Paikka: BIO2 sh 3041
Vastuuhenkilö: Prof. Pirkko Vihko.
Edeltävät opinnot: Biokemian perustyöt A, 510011 Entsyymit ja aineenvaihdunta, 52736 Geenitekniikka tai vastaavat opinnot
Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on oppia ymmärtämään ne biokemialliset perusteet,joita käytetään ihmisen eri elinten terveen ja sairaan toiminnan analysoimiseksi. Lisäksi käydään läpi analyyttinen päätöksentekoprosessi: mitä analysoidaan ja miten tuloksia tulkitaan.
Kirjallisuus: Luennoilla jaettava materiaali ja loppukuulustelukirjat.
Suoritustavat: Luentojen lisäksi opiskelijat laativat aiheeseen liittyvän seminaariesityksen sekä perehtyvät omatoimisesti kirjallisuuteen.
Lisätiedot: Kurssi on pakollinen Terveyden biokemian linjalla, muille opiskelijoille kurssi on valinnainen.
Tentit:
Arvostelu: 0-5.

510012 Molekulaarinen solubiologia / Molecular Cell Biology (5 op, 5 credits)
Aika: ma, ke 2.11. - 9.12.2009, klo 10-12
Paikka: BIO2 auditorio 1041
Vastuuhenkilö: Dos Esa Kuismanen
Edeltävät kurssit: 529001 Biotieteiden perusteet I, 51072 Biomolekyylit sekä erittäin suositeltavana 52949 Molekyyligenetiikka
Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tarkoituksena on perehdyttää opiskelija solun rakenteiden ja toimintojen biokemialliseen perustaan, erityisesti geneettisen informaation toteutumiseen proteiinien ja solurakenteiden tasolla. Kurssilla käsitellään mm. mRNA synteesi ja muokkaus, proteiinien biosynteesi, proteiinien translaation jälkeinen muokkaus, proteiinien kohdenta-minen solurakenteisiin ja organelleihin, solun eritysreitti, endosytoosi, solun tukiranka, plasmamembraani ja solun ulkoinen matriksi. Kurssilla käsitellään lisäksi solujen säätelyme-kanismeja ja niihin liittyviä solun sisäisen ja solujen välisen signalloinnin periaatteita.
Kirjallisuus: Nelson ja Cox: Lehninger Principles of Biochemistry, uusin painos (soveltuvat kappaleet); Alberts et al.: Molecular biology of the cell (uusin painos)
Suoritustavat: Luennot (24 tuntia) ja omatoiminen kirjallisuuteen perehtyminen.
Tentit:
Arvostelu: Kirjallinen tentti arvosteluasteikolla 0-5.

51080 Molekulaarinen biofysiikka / Molecular Biophysics (3 op)
Aika: 2.11.-3.12.2009 ma klo 12-14 to klo 12-14
Paikka: ma VIB LS 4, to INFO ls 4
Vastuuhenkilö: Prof. Arto Annila
Edeltävät opinnot: Kemian perusteet tai vastaavat opinnot
Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla perehdytään biologisten makromolekyylien rakenteen ja toiminnan tutkimuksen fysikaalisiin menetelmiin. Tavoitteena on ymmärtää valon ja aineen vuorovaikutuksen yleiset periaatteet ja tuntea niihin liittyvät peruskäsitteet. Tiedot antavat edellytykset mm. optisen spektroskopian ja röntgensäteiden diffraktion käyttöön.
Suoritustavat: Luennot, laskuharjoitukset ja tentti arvosteluasteikolla 0-5.
Kurssikirjallisuus: Luentomuistiinpanot, Kensal van Holde, Physical Biochemistry
Tentit:
Arviointi: Kirjallinen tentti arvosteluasteikolla 0-5

51078 Myrkytys- ja huumeanalytiikan kurssi / Course in Toxicology and Drug Analysis
(2 op)
Aika: 17.11. - 15.12.09 tiistaisin ja torstaisin 14.00-16.00
Paikka: AUD 1041 (Biokeskus2)
Vastuuhenkilö: Dos. Ilkka Ojanperä
Tavoitteet ja sisältö: Kurssi antaa perustiedot väärinkäytetyistä aineista, erityisesti huumaus- ja lääkeaineista, ja niiden analytiikasta oikeuslääketieteen, sairaalan myrkytysdiagnostiikan, huumetestauksen ja dopingin piirissä. Opetuksessa painotetaan yleistä näkemystä aiheeseen yksittäisten analyysitekniikoiden tai -menetelmien sijasta. Kurssiin sisältyy opintokäyntejä
Suoritustavat: Luennot ja itsenäinen kirjallisuuteen perehtyminen
Arviointi: Kirjallinen tentti arviointiasteikolla 0-5
Oppimateriaali: Luennoilla jaettava materiaali
Lisätietoja: Kurssille on rajoitettu osallistujamäärä (70)
Ilmoittautuminen: WebOodi

920001 Molecular Neurobiology 3op

52773 Immunobiologia (3 op). Katso perinnöllisyystiede

Työkurssit

52025 Biokemian harjoitustyöt / Practical Labwork in Biochemistry (3 op)
Aika: Ryhmä 1) 15.9-6.10.2009, ti klo 14-20, to klo 11-17, pe klo 11-17 (20 opiskelijaa).
Ryhmä 2) 19.10.-30.10.2009 (40 opiskelijaa),ma-pe klo 11-17
Ryhmä 3) 2.11. - 13.11.2009 (2 ruotsinkielistä ryhmää, 40 opiskelijaa),ma-pe klo 11-17
Ryhmä 4) 16.11.-27.11.2009 (10 opiskelijaa), ma-pe klo 11-17
Ryhmä 5) 30.11.- 11.12.2009 (10 opiskelijaa) ,ma-pe klo 11-17
Paikka: Biokemian osaston kurssisalit, BIO2, 2. kerros.
Vastuuhenkilö: Yliopisto-opettaja Carmela Kantor-Aaltonen
Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tavoitteena on perehtyä tärkeimpien biologisten molekyylien omi-naisuuksiin ja oppia turvallisen laboratoriotyöskentelyn perusteet. Tavoitteena on tutustuttaa opiskelija yleisimpiin biokemiallisiin laboratoriotekniikoihin. Kurssi koostuu yhdeksästä assistentin ohjauksella suoritettavasta harjoitustyöstä (Liuosten valmistus, Happoemästitraus, Veren fraktiointi, Plasman fraktiointi anioninvaihtokromatografialla, Proteiinipitoisuuden määritys, SDS-PAGE, DNA:n eristys, Veren lipidikoostumuksen määritys ohutlevykromato-grafialla, NADP + :n ja NADPH:n absorptiospektrien ja glukoosipitoisuuden entsymaattinen määritys)
Kirjallisuus: Kurssimoniste
Suoritustapa: Osallistuminen harjoitustöihin, työpäiväkirja ja työselostus
Edeltävät suoritukset: Kurssi sopii ensimmäisen vuoden opiskelijalle
Arviointi: Kirjallinen tentti, työpäiväkirja ja työselostukset asteikolla hyväksytty/hylätty
Ilmottautuminen: WebOodi

51056 Biokemian perustyöt A /Basic Labwork in Biochemistry A (9 op)
Aika: 1 ) kurssi: 9.11.-11.12.2009
2) kurssi: 18.1.-19.2.2010
3) kurssi: 22.2.-26.3.2010, tähän ryhmään on tulossa 15 + 2 = yht. 17 MMTDK ja TKK:N HeBiot opiskelijaa
Paikka: Biokemian osaston kurssisali 2037, 2. kerros
Vastuuhenkilö:Yliopistonlehtori Pirjo Nikula-Ijäs
Ilmottautuminen: WebOodi
Edeltävät opinnot: Minimivaatimuksena ovat kemian perusteet, biotieteiden perusteet I tai vastaavat opinnot, biomolekyylit, biokemian harjoitustyöt (3 op) tai vastaavia kemian harjoitustöitä.
Kurssikuvaus: Biokemian perustyöt koostuvat kahdesta osakurssista, perustyöt A ja B, 9+9 op. Biokemian perustyöt A:stä on saatava vähintään 3/5 biokemian tutkimusprojektit -työkursseille pääsemiseksi. Työt suoritetaan paritöinä omaan tahtiin assistenttien ohjauksessa. Kurssilla perehdytään proteiinien sekä muiden biomolekyylien (membraaniproteiinit, membraanilipidit, sytokromi c ja entsyymikinetiikka) eristämiseen ja karakterisointiin. Lisäksi tärkeätä on itsenäiseen työskentelyyn oppiminen, tieteellisten koetulosten raportointi ja työturvallisuuteen perehtyminen.
Suoritustapa:Laskuharjoitukset, luennot, laboratoriotyöskentely, seminaari, verkko-oppimisjakso, tentti.
Arviointi: Töiden suoritus, laboratoriopäiväkirja ja päättökuulustelu asteikolla 0-5
Lisätiedot: Biokemian perustyöt A:stä on saatava vähintään 3/5 51031 Biokemian tutkimusprojektit-työkurssille pääsemiseksi
Linkki: BlackBoard

51031 Biokemian tutkimusprojektit / Biochemical Research Projects(24 op)
Aika: Lukuvuoden aikana järjestetään kaksi kurssia: syyslukukaudella 7.9 - 11.12.2009 jatkuen 11.1. – 22.1.2010 ja kevätlukukaudella 25.1.2010 – 21.5.2010.
Yhteyshenkilö: Dos. Esa Kuismanen.
Hakuaika: Kurssille haetaan Web Oodin kautta edellisen lukukauden päättymiseen mennessä.
Kurssikuvaus: Opintojaksossa tehdään kaksi kokopäiväistä kahdeksan viikon tutkimus-projektia, joista vähintään toinen on suoritettava biokemian osaston tutkimusryhmissä. Projektien tulee olla aihepiiriltään ja menetelmiltään toisistaan poikkeavia ja ne tehdään kahdessa eri laboratoriossa. Toisen projekteista pitää sopia aiheeltaan maisteritutkinnon erikoistumislinjaan. Perustelluista syistä voidaan toinen projektityö suorittaa pääaineen professorin kanssa etukäteen sovittavana erillisenä 12 op:n opintokokonaisuutena, jossa on biokemian alan tekniikoihin tai laboratoriotyöhön perehdyttäviä opintojaksoja.

Opintojakso perehdyttää työskentelyyn ajankohtaisen tutkimusongelman parissa. Tärkeä osa opintojaksoa on tutkimusongelmaan liittyvään kirjallisuuteen perehtyminen. Tavoitteena on oppia tieteellisen työskentelyn periaatteita, keskeisiä tekniikoita ja niiden soveltamista tutkimusongelmaan. Tutkimusprojektilla on nimetty ohjaaja, jonka kanssa laaditaan ennen työn aloittamista noin sivun pituinen projektisuunnitelma, joka sisältää työn taustan, kysymyksen-asettelun ja käytettävät menetelmät. Projektityöstä pidetään laboratoriopäiväkirjaa, jossa dokumentoidaan alkuperäistulokset. Projekteista laaditaan suomen-, ruotsin- tai englannin-kielinen julkaisumuotoinen raportti. Raportti sisältää johdannon, materiaalit ja menetelmät, tulokset, tulosten tarkastelun ja kirjallisuusviitteet. Raportti on ehdottomasti jätettävä tarkastetta-vaksi ohjaajalle projektin viimeisen viikon lopussa. Raportin viivästyminen voi johtaa opintosuorituksen hylkäämiseen.

Projektien aikana osallistutaan laudatur-seminaareihin. Seminaareissa opiskelija pitää kaksi esitelmää, yhden suppeamman projektityöhön liittyvän esitelmän ja yhden laajemman ajankohtaiseen kirjallisuuteen liittyvän esitelmän. Laajemmasta esitelmästä laaditaan sivun pituinen kirjallinen tiivistelmä. Seminaarien tavoitteena on alkuperäisten tutkimustulosten kriittinen tarkastelu.
Edeltävät suoritukset: LuK-tutkinto tai vähintään biokemian perustyöt A (51056) ja B (51057) (molemmat vähintään arvosanalla 3/5), biokemian loppukuulustelu (51015) (6 op), biokemiallinen koetekniikka (51036) , radiokemian peruskurssi (55727) ja säteilysuojelun kurssi (55722).
Arvostelu: Projektityön ohjaaja hyväksyy sekä työsuorituksen arvosanalla että kirjallisen osan (projektisuunnitelma, laboratoriopäiväkirja ja raportti) arvosanalla 1-5. Seminaariosuuden hyväksyy seminaarin ohjaaja. Kurssin kokonaisarvosana määräytyy arvosteltujen suoritusten keskiarvona. Suoritus rekisteröidään sen jälkeen kun molemmista projekteista on jätetty hyväksytty raportti ja seminaariosuus on merkitty suoritetuksi.

510018 Kliinisen biokemian laboratoriokurssi/ Practical Labwork in Clinical Biochemistry (3 op)
Aika: 30.11.-18.12. 2009 mikäli osallistujia on vähintään 10, muuten kurssi järjestetään syksyllä 2010 (II periodi).
Töiden informaatio ja ensimmäinen kokoontuminen on ma 30.11. klo 12-14, sh3041
Vastuuhenkilö: prof. Pirkko Vihko ja yliopistonlehtori Pia Siljander
Ilmottautuminen: WebOodi Ilmoittautuminen 15.10.2009 mennessä
Tavoitteet ja sisältö: Tutustuttaa sairaalalaboratorion ja laboratorioalan yritysten toimintaan. Tavoitteena on hallita keskeiset kliinisessä laboratorio-analytiikassa käytettävät menetelmät. Omaa laboratoriotyöskentelyä sekä laboratorio- ja yrityskäyntejä. Töissä perehdytään mm. kemian analysaattoreihin, immunoanalysaattoreihin, verisolulaskentaan, virtaussytometriaan, HPLC-sovellutuksiin ja massaspektrometriaan kliinisessä laboratoriossa. Käydään läpi laitteiden ja menetelmien periaatteet, analytiikan käyttöalueet terveydenhuollossa, analyysin tekeminen, laadunvarmistus, analytiikan ylläpito ja biokemistin osuus ko. tehtävissä.
Suoritustavat: Edellyttää aktiivista läsnäoloa ja työselostusten laatimista.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Kurssilla jaettava materiaali.
Edeltävät suoritukset: Biokemian perustyöt A, 5, 510011 Entsyymit ja aineenvaihdunta, 52736 Geenitekniikka, 51212 Kliininen biokemia. 510017 Fysiologista biokemiaa suositellaan suoritettavaksi ennen Kliinistä biokemiaa ja työkurssia.
Arviointi: Hyväksytty/Hylätty.
Lisätiedot: Kurssi on pakollinen Terveyden biokemian linjalla.

510021 Cell Fractionation and Electron Microscopy (5 op)
Time: The course will be organized next time 2010-2011
Organiser: University Lecturer Eeva-Liisa Eskelinen.
Course description: The course will introduce two central methods in cell biology, cell fractionation using density gradients, and transmission electron microscopy. The course consists of a theoretical part (lectures, seminars and workshops) and a practical part in the laboratory. The practicals will focus on endocytosis in cultured cells using soluble tracers.
Course material: the course manual as well as material for the background of the methods will be distributed to course participants in the beginning of the course. Active participation in the lectures, seminars, workshops and practicals, as well as written reports of the practicals and the course exam are required to pass the course.
Evaluation: Course evaluation is based on activity in the practicals, success in studytasks given during the course, and the course exam. The scale is 0-5.
Background knowledge: Basic knowledge on biochemistry laboratory work (Courses 51056 and 51057) is the prerequisite for participating the course. Previous experience on cell culture is recommendable for but not absolutely necessary.
The course is also suitable for PhD studies.
Applications should be sent by e-mail to Eeva-Liisa.Eskelinen(at)Helsinki.Fi. Deadline for applications:
Additional information: The course is in English and it is is also suitable for PhD studies.

51046 Proteiinitutkimuksen menetelmiä / Methods in Protein Research (5op)
Aika: 2011, periodi 4
Paikka: Biokemian osaston kurssisali, BIO2
Vastuuhenkilö: Yliopistonlehtori Pirjo Nikula-Ijäs
Tavoitteet ja sisältö: Kursilla perehdytään proteiinin rakenteen ja/tai toiminnan selvittämiseen käytettäviin menetelmiin kuten mahdollisesti 2D-PAGE, massaspektrometria, CD-spektroskopia, proteiinivuorovaikutusten kineettiset mittaukset, proteiinin puhdistus yleisesti. Tavoitteena on että opiskelija ymmärtää näiden menetelmien soveltuvuusalueet ja osaa niiden pohjalta suunnitella tieteellisiä kokeita. Laboratorioharjoitutöitä tukee luennot ja opiskelijoiden pitämät seminaarit. Luennoilla ja seminaareissa tutustutaan myös muihin proteiinitutkimuksen menetelmiin.
Opetusmuotona ovat laboratorioharjoitustyöt, luennot, seminaarit. Kurssi soveltuu myös jatko-opintoihin.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Kurssimoniste sekä alaan liittyviä artikkeleita ym. materiaalia jaetaan kurssin aikana.
Surotustavat: Laboratorioharjoitustyöt, luennot ja seminaarit
Edeltävät opinnot: Biokemian perustyöt A, 51015 biokemian loppukuulustelu (6 op)
Arviointi: Arviointi perustuu osallistumisaktiivisuuteen, oppimispäiväkirjaan ja seminaariin asteikolla 0-5
Linkki: BlackBoard

51125 Molekyylibiologian menetelmät / Methods in Molecular Biology (5 op)
Aika: Luennot (1 op) 12.10-16.10.2009 ma-pe klo 10-12,
laboratoriotyöt (4 op) lokakuussa 2009
Paikka: Luennot BIO2, sh 3041
Vastuuhenkilö: Yliopistonlehtori Suvi Taira
Ilmoittautuminen: WebOodi. Kurssille mahtuu 12 henkilöä.
Edeltävät opinnot: Kurssi on tarkoitettu ensisijaisesti kandidaattitutkinnon suorittaneille.
Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehdyttää opiskelijat keskeisiin molekyylibiologian menetelmiin. Näitä ovat PCR, mukaan lukien alukkeiden suunnittelu, kloonaus, proteiinien ylituotanto, RNA hybridisaatiot sekä geeniaktiivisuuden seuraaminen erilaisten reportteri-fuusioiden avulla. Lisäksi tehdään tehdään henkilön tunnistus KRP:n tapaan. Käytännön laboratorioharjoituksia tukevat teorialuennot, joiden sisältö kuuluu tenttiin. Kurssin hyväksyttyyn suorittamiseen sisältyy tentti, aktiivinen läsnäolo laboratoriossa, PCR luennot ja yhteisiin wiki-luentomuistiinpanoihin osallistuminen, sekä alukkeiden suunnittelu- ja sekvenssianalyysi-harjoituksia.
Arviointi: 1-5 Tenttiarvosanan ja osallistumisaktiivisuuden perusteella

Muut opinnot

570012 HOPS (Maisteri) (1 op)
Biokemia tieteessä
Aika: 14-23.9.2009, ma ja ke klo 16-18 >> luentojen ohjelma
Paikka: BIO2 sh 3041
Vastuuhenkilö: Yliopisto-opettaja Carmela Kantor-Aaltonen
Tavoitteet ja sisältö: Osa maisterivaiheen HOPS opintoja. Dosenttiluentosarja, jossa esitellään biokemian eri tutkimusalueita ja menetelmiä.
Urapäivä
Aika: pe 25.9.2009 klo 9-14 >> Urapäivän ohjelma
Paikka: BIO2 sh 3041
Tavoitteet ja sisältö:Osa maisterivaiheen HOPS-opintoja. Urapäivän tarkoituksena on käsitellä työnhakuprosessia, työllisyystilannetta ja esitellä biokemistejä erilaisissa työtehtävissä.
Edeltävät opinnot: Kandivaiheen opinnot
Linkki:
Arvostelu:Hylätty/Hyväksytty, läsnäolo vähintään 6:lla luennolla + urapäivä

510010 Principles of Business (4 op, 4 credits)
Time: September 8 to October 1(8.9. - 1.10.2009), Tue and Thu at 9am to 1 pm (9-13)
Place: September 8-17 (8-17.9) BIO2, LS 1015, September 22 and 29 (22.9. and 29.9) , BIO3 , LS2402, September 24 and October 1 (24.9 and 1.10) BIO2, LS2012
Organizers and Contact Information: University Instructor Carmela Kantor-Aaltonen in collaboration with HEBIOT and HSE
Course description: Introduction to marketing(8 h), management ( 8 h), accounting
( 8 h)and business environment (8 h) , altogether 32 h of lectures. Lecturers are from the Helsinki School of Economics.
Previous studies: Non required
Registration: WebOodi
Requirements for passing the course: An exam
Links:

51036 Biokemiallinen koetekniikka / Practical Techniques in Biochemistry (4 op)
Kuulusteluun voi osallistua lokakuun, marraskuun, maaliskuun ja huhtikuun biokemian yleisinä tenttipäivinä klo 12-14. Muita kuulusteluja ei järjestetä.
Vastuuhenkilö: Dos Esa Kuismanen.
Edeltävät opinnot: Biokemian perustyöt A ja B
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Aineistona on kirjasta Reed ja muut: Practical Skills in Biomolecular Sciences, Pearson, kolmas painos, sivut 121-163 ja 203 – 446, ja kirjasta: Alberts et al. Molecular Biology of the Cell, viides painos, kappaleet 8 ja 9.
Suoritustapa: omatoiminen opiskelu
Lisätiedot: Ennakkovaatimuksena Biokemian tutkimusprojekteihin
Arviointi: Kirjallinen tentti, arvostelu asteikolla 0-5

51081 Tiedonhaku verkossa / Data Mining in the Net (1op)
Aika: 11.9. klo 9.00-12.00 ja 15.9. klo 9.00-12.00
Paikka: Infokeskuksen mikroluokka
Vastuuhenkilö: Yliopistonlehtori Pia Siljander ja tietoasiantuntija Tuula Huuskonen
Ilmottautuminen: WebOodi Ilmoittautuminen 9.9.2009 mennessä
Kurssin sisältö: käydään läpi esim. erilaiset tietokannat, e-lehdet, RefWorks, tieteellinen kommunikointi. Tämä liitetään itsenäiseen hakujen harjoitteluun ja lopputehtävän suoritukseen.
Suoritustapa: Opintojakson hyväksytty suorittaminen edellyttää aktiivista osallistumista ja kirjallisen esseen laatimista.
Edeltävät opinnot: Muutaman vuoden opinnot (2-3 vuotta)
Arviointi: hyväksytty/hylätty
Lisätiedot: Kurssi on pakollinen

510013 Biokemian proseminaari ja äidinkielen opinnot/ Proseminar in Biochemistry (3op)
Aika: Ensimmäinen kokoontumionen 9.9.2009 klo 10-12.
Ilmoittautuminen: WebOodin
Paikka: BIO2, sh 3041.
Vastuuhenkilö: Yliopistonlehtorit Eeva-Liisa Eskelinen ja Pia Siljander
Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on tieteellisen esitystavan tuntemus ja käytännön taito laatia äidinkielisiä tieteellisiä esityksiä. Opintojaksosta osa kuuluu äidinkielen opintoihin. Proseminaarissa tutustutaan biokemiallisen tutkimuskirjallisuuden muotoihin, käytäntöihin ja kriittiseen arviointiin sekä tieteellisen kirjoittamisen perusteisiin, erityisesti kandidaattitutkielman näkökulmasta.
Kirjallisuus: Erikseen jaettava materiaali ja verkkosivut Moodlessa
Suoritustavat: Opintojakson hyväksytty suorittaminen edellyttää aktiivista osallistumista seminaarityöskentelyyn ja kirjallisen esseen laatimista.
Edeltävät suoritukset: 51072 Biomolekyylit, 510011 Entsyymit ja aineenvaihdunta, 510012 Molekulaarinen solubiologia ja 51081 Tiedonhaku verkossa. 51081 on suoritettavissa kurssin yhteydessä.
Arviointi: Hyväksytty/hylätty

51017 Kandidaatintutkielma (6 op)
Biokemian kandidaatintutkielma tehdään biokemiallisesta aiheesta ja on 10-20 sivuinen kirjallinen työ yleensä äidinkielellä. Suositellaan että se sisältää valaisevia kuvia. Viiteluettelo sisältää 20-30 viitettä. Kaksi kappaletta annetaan prof. Carl G. Gahmbergille.
Arviointi: Asteikolla 0-5
Suoritustavat: Omatoiminen työskentely
>> LuK -tutkielman ohjauksen ja arvioinnin ohje
Arviointilomake: word, pdf
>> Tiedekunnan ohjeet tutkielmista

50101 Pro gradu (40 op)
Biokemian pro gradu tutkielma tehdään aiheesta, josta sovitaan etukäteen prof. Gahmbergin kanssa, jolloin kirjoitetaan 1-2 sivuisen pro gradu -suunnitelma. Kokeellinen työ kestää 3 kk, mutta sitä voi edeltää jakso, jolloin tutustutaan alan kirjallisuuteen ja menetelmiin.Tutkielma
kirjoitetaan pääsääntöisesti äidinkielellä ja sen pituus on yleensä 60-100 sivua sisältäen kirjallisuuskatsauksen ja kokeellisen osan. Poikkeustapauksissa se voi olla ainoastaan kirjallisuuskatsaus. Tutkielma annetaan 2 kappaleena prof.Gahmbergille.
Arvoidaan asteikolla: laudatur - eximia cla - magna cla- cum laude approbatur - none sine cla - approbatur - improbatur.
Linkki: Ohjeet pro gradu -tutkielman laatimiseksi

51004 Pro gradu -ohjausseminaari (1,5 op)
Vastuuhenkilöt: Yliopistonlehtorit Pirjo Nikula-Ijäs ja Pia Siljander
Syksyn ryhmän viimeinen kokoontuminen 12.1. 2010.
Kevään ryhmän ensimmäinen kokoontuminen 9.2. ja tämän jälkeen 9.2., 2.3.,23.3., 13.4. ja 4.5. klo 16. Poikkeus: ti 13.4. aloitusaika 16.30
Paikka: BIO2, 3 krs., sh 3041
Ilmottautuminen: WebOodi
Kurssin sisältö: käydään läpi Pro gradun suunnitteluun, toteuttamiseen ja kirjoittamiseen liittyviä asioita.
Arviointi: Hyväksytty /Hylätty
Lisätiedot: Kurssin ensimmäinen tapaaminen olisi hyvä ajoittaa ennen Pro gradu -tutkielman kokeellisen osan aloittamista ja muut tapaamiset sopivat kirjoitusprosessin yhteyteen. On suositeltavaa osallistua yhtäjaksoisesti (vähintään 3 kertaa ensitapaamisen lisäksi) joko syys- tai kevätlukukaudella. Kurssin ensitapaaminen järjestetään lukukausien alussa sekä toukokuussa niille, jotka tekevät kokeellista osaa kesällä.

51013 Työpaikkaharjoittelu (1-5 op)
Vastuuhenkilö: Biokemian opintoneuvoja Pirjo Nikula-Ijäs
Biokemian alan työ, ei opinnäytetyö, hyväksytään opintosuorituksena: 3 viikon kokopäivätyö/1,5 op, (riippuen työn vaativuudesta) enintään 5 op. Työpaikkaharjoittelu suositellaan jätettäväksi opintojen loppuvaiheeseen. Suoritus saadaan rekisteriin tuomalla työtodistuksen kopio sekä itse kirjoitettu työselostus tehdystä työstä biokemian opintoneuvojalle.
Arviointi: Hyväksytty /Hylätty

51133 Tutkimusseminaarit / Research Seminars (1-3 op)
Tutkimusseminaareista ja vastaavista, samoin kongresseista voi saada 1-3 op. Vastuuhenkilö: Biokemian opintoneuvoja Pirjo Nikula-Ijäs.